经过众多养猪场反复试验总结，终末生物安全程序（空栏消毒）在猪舍清空后进行，包括对养猪场设备进行清扫和消毒，这是一个权威性的规模化养猪场消毒程序，目标就是清除猪舍存在的病原体和防止病原体的携带者进入养殖区，确保每一批猪都有一个经过有效消毒的、卫生的初始环境。
规模化猪场在国家大力支持环境下，如雨后春笋般涌现出来。但很多养猪户不了解“养猪生物安全”，以至于养猪场一旦出现问题只注重治疗，只注重体内病原菌，而不对环境病原菌采取任何措施，对于集约化养殖的规模化猪场，常导致环境病原菌变异增多，不断地侵入体内造成感染，造成报废性的猪场损失。经过之前的经验教训，养猪户开始逐步的理解和执行终末生物安全程序（空栏消毒）。
作为西南地区领先的规模化养猪场设备生产厂家，四川万春机械提醒我们的设备客户注意以下与规模化养猪设备密切相关的终末生物安全程序的几个步骤：
清除猪舍内所有的污物、粪便、饲料未、胎衣等垃圾。这些垃圾含有大量的污染物，是主要的传染源。大量的污物也将会降低消毒剂的消毒作用与效果，在冲洗之前务必清扫干净，然后冲洗。(也可先用消毒液喷洒地面后，再彻底清扫，以免打扫时病原体飞扬)
- 清空猪舍：猪只移出后，拆卸料槽、保温箱、猪圈隔离物、工具和其他需要移动的及可以移动的养殖设备。
- 清除污染物：清除粪便、饲料未、污垢等，确保猪舍内尽可能的清洁。
- 冲洗：清扫完后，用水冲洗猪舍（特别是产房内的漏缝地板、保温箱）、用具、设备等，从尽可能高的位置开始，一直到最低层或漏缝地板下，用高压水冲洗干净。尤其要注意拐角、保温箱、料槽、饮水器、裂缝和其他污垢沉积的地方。如果有必要，需要擦洗，确保清洁，保证和提高消毒效果。这些养猪设备需晾干后搬回猪舍。
- 消毒前清洁处理：晾干后的猪舍和所有养猪场设备都应该清洗，特别是产房和保育舍，清除沉积的污垢和进一步清洁各种设备，对于规模化养猪场，这点尤为重要。
- 浸泡：用2％火碱清洗。喷射角度为45°（度）角，每平方米喷洒300毫升稀释液，持续浸泡30分钟。
- 晾干：晾干后等待消毒。
2、猪舍和养猪场设备消毒
仅仅用冲洗或简单消毒剂对规模化养猪场进行空舍消毒是不够的，病源的含量、尤其是病毒如果仍高到能对下一批猪产生足够的威胁的话，必须使用广谱消毒剂，对包括病毒、细菌、真菌和其他病原微生物在内的病源进行全面、彻底的消毒才有效。
给规模化猪场造成巨大危害和经济损失的几种常见病毒及引发疾病：
- 蓝耳病毒（PRRSV）引起的呼吸道与繁殖综合征（PRRS）。
- 猪瘟病毒（HCV）引起的各种症状的猪瘟。
- 圆环病毒（PCV-2）引起的子猪断奶衰竭综合征（PMWS）、皮炎肾病综合征（PDNS）。
- 口蹄疫病毒（FMDV）引起的口蹄疫病。
消毒药物的选用：目前除传统使用的消毒药外，新型高效消毒药大量面市，在选用消毒药时应本着高效、经济和人畜无害的原则，应在动物防疫监督部门指导下，最好使用国家指定专用消毒药。
使用消毒剂，参照消毒剂生产厂家提供的稀释比例和用量用法喷洒。
- 喷雾从天棚、墙壁、圈栏、门窗、饲料槽、地面、用具及门口地面均匀喷洒，直到完全浸润猪舍地表面。
- 尤其要注意拐角、裂缝和破碎的地方。还要注意清理可渗透的表面，比如木头表面和水泥表面。
- 特别注意保温箱、漏缝地板及漏缝地板下面要喷洒到消毒液，确保彻底、全面的消毒效果。
- 饮水器、食槽用消毒液洗刷一次。
- 自然晾干之后，进猪。
- 喷雾和空气消毒
以上养猪场设备和猪舍消毒方法程序，需严格执行，才能保证规模化养猪场尽可能少发生感染性疾病或疫情。
